Анализы крови на рнга пцр
Полимеразная цепная реакция известна уже 30 лет. Ее широко используют во многих областях, начиная с археологии и заканчивая генетикой.
Именно метод пцр помогает установить отцовство, но наиболее часто его используют для выявления различных инфекционных болезней в организме человека.
Как проводят анализ методом пцр, и что это такое? На эти вопросы мы постараемся детально ответить.
Анализ ПЦР — что это такое?
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – высокоточный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет выявить у человека различные инфекционные и наследственные заболевания, как в острой и хронической стадии, так и задолго до того, как заболевание может себя проявить.
Метод ПЦР — абсолютно специфичен и выполненный правильно не может дать ложноположительный результат. То есть, если инфекции нет, то анализ никогда не покажет, что она есть. Поэтому сейчас очень часто для утверждения диагноза дополнительно сдают анализ ПЦР, чтобы определить возбудителя и его природу.
Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) в 1983 году разработал Кэри Мюллис (США), за что в 1993 году он удостоен Нобелевской премии в области химии.
В чем преимущество данного метода?
Диагностика этим методом позволяет найти возбудителя непосредственно в гене, который содержится в исследуемых материалах. Это самый точный анализ на половые инфекции, скрытые инфекции, различные венерические заболевания.
Отличия ПЦР-диагностики от других методов лабораторного исследования заключаются в следующем:
- метод нацелен на выявление самого возбудителя;
- диагностика методом ПЦР отличается универсальностью: для обнаружения возбудителей нескольких;
- заболеваний достаточно только одного биологического образца больного;
- метод обладает высокой чувствительностью и не сопровождается другими перекрестными реакциями.
Кроме этого, преимуществом ПЦР-диагностики является то, что для анализа пригоден любой биологический материал пациента: кровь, выделения из половых органов, моча, сперма.
Какие инфекции позволяет выявить мазок на ПЦР?
В организме может присутствовать большое количество возбудителей инфекций, сюда относятся и «скрытые», которые длительное время никак себя не проявляют.
Анализ мазка на ПЦР позволяет выявить такие инфекции:
- гепатит;
- уреплазмоз половых органов;
- кандидоз (молочница);
- хламидиоз половых путей;
- папиллома вирусная инфекция;
- герпес;
- наличие раковых клеток;
- микоплазмоз;
- бактериальный вагиноз;
- инфекционный мононуклеоз;
- трихомониаз;
- оценить гормональное состояние;
- СПИД (ВИЧ).
Исследуемым материалом для ПЦР обычно являются мокрота, слюна, моча, кровь. Перед проведением анализа необходимо тщательно подготовиться к нему, получив предварительную консультацию у врача.
Кровь для ПЦР обычно сдается натощак. Хорошие результаты показывает проведение анализа, когда материал для исследования взят из цервикального канала или уретры. В этом случае лучше всего провести ПЦР-диагностику не позже, чем через сутки после полового акта.
Разновидности ПЦР
ПЦР используется во многих областях для проведения анализов и в научных экспериментах. Существуют разные методики проведения анализа:
- ПЦР с обратной транскрипцией (Reverse Transcription PCR, RT-PCR (англ.)) — используется для амплификации, выделения или идентификации известной последовательности из библиотеки РНК.
- Инвертированная ПЦР (Inverse PCR (англ.)) — используется в том случае, если известен лишь небольшой участок внутри нужной последовательности. Этот метод особенно полезен, когда нужно определить соседние последовательности после вставки ДНК в геном.
- Вложенная ПЦР (Nested PCR (англ.)) — применяется для уменьшения числа побочных продуктов реакции. Используют две пары праймеров и проводят две последовательные реакции.
- Асимметричная ПЦР (англ. Asymmetric PCR) — проводится тогда, когда нужно амплифицировать преимущественно одну из цепей исходной ДНК. Используется в некоторых методиках секвенирования и гибридизационного анализа.
- Количественная ПЦР (Quantitative PCR, Q-PCR (англ.)) или ПЦР в реальном времени — используется для непосредственного наблюдения за измерением количества конкретного ПЦР продукта в каждом цикле реакции.
- Ступенчатая ПЦР (Touchdown PCR (англ.)) — с помощью этого подхода уменьшают влияние неспецифического связывания праймеров.
- Групп-специфическая ПЦР (англ. group-specific PCR) — ПЦР для родственных последовательностях внутри одного или между разными видами, используя консервативные праймеры к этим последовательностям.
Если нуклеотидная последовательность матрицы известна частично или неизвестна вовсе, можно использовать вырожденные праймеры, последовательность которых содержит вырожденные позиции, в которых могут располагаться любые основания. Например, последовательность праймера может быть такой: …ATH…, где Н — А, Т или С.
Какие биологические материалы исследуются?
Материалом для ПЦР-исследования, в котором можно выявить чужеродную ДНК бактерии или ДНК или РНК вируса могут служить различные биологические среды и жидкости человека:
- Моча. Может использоваться при инфекционном поражении мочеполового тракта у мужчин и мочевыделительных органов у женщин (у мужчин использование в качестве материала мочи заменяет эпителиальный соскоб).
- Мокрота. Применяется для диагностики туберкулеза и реже для диагностики респираторных форм хламидиоза и микоплазмоза. Мокроту в количестве 15-20 мл собирают в стерильный (одноразовый) флакон.
- Биологические жидкости. Сок простаты, плевральная, спинномозговая, околоплодная, суставная жидкость, бронхоальвеолярный лаваж, слюна забираются по показаниям.
- Эпителиальные соскобы со слизистых оболочек. Обычно используются для диагностики заболеваний, передающихся половым путем (ЗППП), таких как гонорея, хламидиоз, микоплазмоз, уреаплазмоз, трихомониаз, гарднереллез, герпетическая и другие инфекции, поражающие слизистые оболочки.
- Биоптаты. Чаще всего используют биоптаты желудка и двенадцатиперстной кишки для выявления хеликобактерной инфекции.
- Кровь, плазма, сыворотка. Используются для ПЦР анализа вирусов гепатитов B, C, D, G, герпеса, ЦМВ, ВИЧ, исследования генов человека.
Как подготовиться к сдаче анализа?
Достоверность результата ПЦР напрямую зависит от правильности сдачи материала на обследование. Материал не должен быть загрязнен, иначе результат исследования не будет объективен. К наиболее важным рекомендациям перед сдачей анализа ПЦР относятся следующие требования:
- Моча сдается утром в стерильный контейнер.
- Анализ крови на инфекции необходимо сдавать на голодный желудок в утреннее время.
- Не стоит проявлять половую активность за сутки до проведения анализа.
Результат анализа будет готов через 1,5-2 суток после проведения рассматриваемой процедуры. Встречаются такие ситуации, когда результат может быть подготовлен в тот же день.
Расшифровка анализа ПРЦ
Процесс интерпретации представленного исследования отличается своей простотой. Результаты пцр анализа можно получить через 1,5-2х суток после сдачи материала. В некоторых случаях результат готов в первый же день, и вот что они могут означать:
- Отрицательный результат показывает, что в диагностируемом материале отсутствует искомый инфекционный возбудитель.
- Пцр положительный обозначает, что в организме человека присутствует ДНК или РНК возбудителя.
В некоторых случаях производят количественное определение микроорганизмов. Это особенно актуально при заболеваниях, вызванных условно-патогенными микроорганизмами. Так как данные бактерии проявляют свое негативное воздействие лишь при избыточном количестве.
Также количественный анализ ПЦР важен для выбора терапевтической тактики и с целью контроля над лечением таких вирусных инфекций, как ВИЧ и вирусы гепатита.
Насколько точна ПЦР диагностика инфекций?
Метод ПЦР отличается высокой точностью, специфичностью и чувствительностью. Это означает, что данный анализ способен:
- точно определить наличие или отсутствие инфекции;
- точно указать, что именно это за инфекция (специфичность);
- обнаружить инфекцию даже при очень низком содержании ДНК микробов в биологическом материале,
- который был подвергнут исследованию (чувствительность).
ПЦР анализ: цена и сроки
Цена конкретного анализа будет зависеть от того, на какую инфекцию вы будете проверяться. Примерные цены и сроки:
- ИППП: 300-500 руб, сроки – 1 день;
- Вирус Эпштейна-Барра, вирус папилломы человека, герпеса, цитомегаловирус: 300-500 руб, сроки – 1 день;
- Гепатит A, B, C, D, G: качественный анализ 650 руб, количественный анализ 2000 руб. Сроки – до 5 дней;
- Антитела к вирусу гепатита С, суммарные ( Anti-HCV ) – 420 руб;
- Антитела к вирусу гепатита C, IgM ( Anti-HCV IgM ) – 420 руб;
- Хеликобактер пилори (Helicobacter pylori): 300-400 руб, сроки – 1 день;
- ВИЧ (антитела и антигены) – 380 руб;
- РНК ВИЧ, качественно – 3 500 руб;
- РНК ВИЧ, количественно – 11 000 руб.
Чтобы сэкономить средства, можно выбирать фиксированный пакет анализов. Такую услугу предоставляет большинство клиник где можно сдать анализ методом ПРЦ (инвитро, онклиник и т.д).
Источник
Гепатит А
Гепатит В
Гепатит С
Вирус гепатита C, генотип 1, 1а, 1b, 2, 3, 4, 5, 6, РНК (HCV, ПЦР ультрачувствит.) плазма, кач. | 19.129. | 10 дней |
Вирус гепатита C, генотип 1a, 1b, 2, 3a, 4, 5a, 6, РНК (HCV, ПЦР) плазма, кол. | 19.97. | 3 дня |
Гепатит D
Гепатит G
Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ)
Гарднерелла вагиналис
Гарднерелла вагиналис (качественный анализ)
Гарднерелла вагиналис (количественный анализ)
Кандида альбиканс
Кандида альбиканс (качественный анализ)
Кандида альбиканс (количественный анализ)
Комплексное исследование на грибы рода Кандида
Микоплазма хоминис
Микоплазма хоминис (качественный анализ)
Микоплазма хоминис (количественный анализ)
Уреаплазма уреалитикум
Уреаплазма уреалитикум (качественный анализ)
Уреаплазма уреалитикум (количественный анализ)
Биовары U.Urealyticum (качественный анализ)
Биовары U.Urealyticum (количественный анализ)
Микоплазма гениталиум
Микоплазма гениталиум (качественный анализ)
Микоплазма гениталиум (количественный анализ)
Нейссерия гонореи
Нейссерия гонореи (качественный анализ)
Нейссерия гонореи (количественный анализ)
Трихомонас вагиналис
Трихомонас вагиналис (качественный анализ)
Трихомонас вагиналис (количественный анализ)
Хламидия трахоматис
Хламидия трахоматис (качественный анализ)
Хламидия трахоматис (количественный анализ)
Трепонема паллидум
Трепонема паллидум (качественный анализ)
Лактобактерии
Лактобактерии (качественный анализ)
Лактобактерии (количественный анализ)
Мобилункус
Мобилункус (качественный анализ)
Мобилункус (количественный анализ)
Бактероиды
Папилломавирусная инфекция
Папилломавирусная инфекция (качественный анализ)
Папилломавирусная инфекция (количественный анализ)
Цитомегаловирус (вирус герпеса 5 типа)
Цитомегаловирус (качественный анализ)
Цитомегаловирус (количественный анализ)
Вирус простого герпеса 1, 2 типов
Вирус простого герпеса 1,2 типов (качественный анализ)
Вирус простого герпеса 1,2 типов (количественный анализ)
Вирус простого герпеса VI
Вирус простого герпеса VI типа (качественный анализ)
Вирус простого герпеса VI типа (количественный анализ)
Варицелла Зостер (вирус герпеса 3 типа)
Вирус Варицелла-Зостер (качественный анализ)
Вирус Эпштейна-Барр (вирус герпеса 4 типа)
Вирус Эпштейна-Барр (вирус герпеса 4 типа) (качественный анализ)
Вирус Эпштейна-Барр (вирус герпеса 4 типа) (количественный анализ)
Краснуха
Краснуха (качественный анализ)
Краснуха (количественный анализ)
Клещевые инфекции
Клещевой энцефалит
Боррелия бургдорфери (качественный анализ)
Боррелия бургдорфери (количественный анализ)
Бордетелла пертуссис
Микоплазма пневмонии, Хламидия пневмонии
Нейссерия менингитидис, Гемофилус инфлюенца, Стрептококкус пневмонии
Острые кишечные инфекции
Микобактерии туберкулеза
Микобактерии туберкулеза (качественный анализ)
Хеликобактер пилори (Метод Real-Time)
Хеликобактер пилори (качественный анализ)
Хеликобактер пилори (количественный анализ)
Токсоплазма Гонди
Токсоплазма Гонди (качественный анализ)
Токсоплазма Гонди (количественный анализ)
Листерия моноцитогенес
Источник
ПЦР — метод лабораторной диагностики, позволяющий определить наличие возбудителя болезни, даже если в пробе присутствует всего несколько молекул его ДНК.
Подробнее…
Для того чтобы результаты анализов были максимально достоверными, необходимо правильно подготовиться к их сдаче.
Как подготовиться?
Высокотехнологичные лабораторные методы диагностики дают возможность выявить множество заболеваний на самых ранних стадиях. Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) — один из самых новых и точных способов диагностики. За его разработку ученый Кэри Муллис получил в 1993 году Нобелевскую премию. Сегодня этот метод хотя и считается экспериментальным, но уже широко и успешно применяется в медицине.
ПЦР-диагностика: суть подхода
Метод ПЦР использует принципы молекулярной биологии. Его суть заключается в применении особых ферментов, которые многократно копируют фрагменты РНК и ДНК возбудителей болезни, которые находятся в пробах биоматериала, например в крови.
После этого работники лаборатории сверяют полученные фрагменты с базой данных, выявляют тип возбудителя болезни и его концентрацию.
ПЦР проводят в амплификаторе — приборе, охлаждающем и нагревающем пробирки с пробами биоматериала. Нагрев и охлаждение необходимы для проведения репликации. Точность температурного режима влияет на точность результата.
Сферы применения метода
Диагностические возможности метода ПЦР огромны, с его помощью можно выявить самые разные инфекции. Чаще всего ПЦР-метод применяют для диагностики:
- ВИЧ;
- герпеса;
- различных половых инфекций, в частности хламидиоза, уреаплазмоза, гарднереллеза, микоплазмоза и трихомониаза;
- кандидоза;
- гепатитов;
- мононуклеоза;
- листериоза;
- цитомегаловируса;
- туберкулеза;
- вируса папилломы человека;
- клещевого энцефалита.
Это далеко не полный список, метод ПЦР-анализа используется в разных областях медицины.
Кстати
Метод ПЦР применяется не только в медицинских целях. В наши дни он используется и в иных сферах, например в криминалистике, в тех случаях, когда требуется определить, кому принадлежит найденный на месте преступления биоматериал. ПЦР иногда используется также при установлении отцовства.
Преимущества и недостатки подхода
У диагностики методом ПЦР много плюсов:
Высокая чувствительность. Метод позволяет выявить возбудителя болезни даже при наличии нескольких молекул его ДНК, то есть на очень ранних стадиях, при хронической форме заболевания, а так же в случаях, когда болезнь никак себя не проявляет, протекая латентно.
Универсальность. Для проведения ПЦР анализа подходит почти любой биоматериал — от крови и слюны до клеток кожи.
Широкий охват. Исследование одного образца может выявить сразу нескольких возбудителей болезни.
Оперативность. Результат, как правило, готов через 5–7 часов, то есть получить заключение можно уже на следующий день после забора биоматериала.
Точность. Метод ПЦР практически никогда не дает ложноположительных или ложноотрицательных результатов, если была соблюдена технология проведения этого анализа.
Невысокая стоимость. По цене ПЦР-анализ сравним с любыми другими лабораторными анализами крови.
Однако следует понимать, что совершенных методов анализа не бывает. У ПЦР есть и минус — высокие требования к соблюдению технологии и к профессионализму лаборантов. Если образец был загрязнен, анализ может дать ложный результат. Поэтому проводить ПЦР-диагностику лучше только в самых лучших лабораториях, где внедрены системы контроля качества работы.
Исследуемый биоматериал
Для ПЦР-диагностики заболеваний на анализ берут разные виды биоматериала. Выбор зависит от типа инфекции. При анализе на ЗППП методом ПЦР берут соскоб или мазок из шейки матки или уретры, а также мочу. Для выявления герпеса, цитомегаловируса, гепатита, токсоплазмоза и ВИЧ на анализ берут кровь. При анализе на мононуклеоз и цитомегаловирус берут мазок из зева. Спинномозговая жидкость используется для анализа при поражениях нервной системы, для диагностики внутриутробных инфекций исследуются ткани плаценты, для выявления легочных инфекций — мокрота или плевральная жидкость.
Подготовка к исследованию
Подготовка к ПЦР-диагностике напрямую зависит от типа биоматериала. Кровь сдается натощак утром. Моча также сдается утром, в лабораторных условиях, в стерильный контейнер. Перед сдачей мазка или соскоба из урогенитальной области нельзя вступать в половые контакты за несколько дней до исследования, не следует проводить спринцевания. Мазок или соскоб нельзя сдавать во время менструации и в течение 2-х дней после ее окончания.
Методы ПЦР-диагностики заболеваний
Существует немало различных методик ПЦР-диагностики: ПЦР в реальном времени, секвенирование, пиросеквенирование, микрофлюидные технологии. Сейчас наиболее распространенным способом проведения анализа является ПЦР в реальном времени — этот метод практически не допускает ложноположительных результатов, к тому же срок обработки образцов при исследовании таким способом сокращается — результат можно получить уже через час.
Расшифровка результатов
Для пациента результат ПЦР-анализа может быть либо положительным, либо отрицательным. Отрицательный означает, что следов враждебной ДНК не обнаружено и человек здоров. Положительный подразумевает наличие фрагментов ДНК возбудителя болезни — это значит, что человек заражен и ему требуется лечение.
Нередко ПЦР-диагностика дает положительный результат, но пациент не чувствует никакого недомогания, а признаки болезни отсутствуют. Однако это означает не ошибку, а очень раннюю стадию заболевания. В этом случае необходимы дополнительные исследования и лечение. Если заболевание было диагностировано на столь ранней стадии, следует начинать терапию как можно скорее, ведь чем дальше зайдет болезнь, тем сложнее будет ее вылечить.
ПЦР-диагностика инфекций невероятно точна — она позволяет обнаружить возбудителя болезни, даже если в пробе находится всего одна-единственная молекула его ДНК. Именно это качество сделало ПЦР-анализ одним из эффективнейших диагностических инструментов как для определения наличия инфекции, так и для контроля за ходом лечения.
Источник