Анализ крови на рнк генотип

РНК гепатита С – это молекула, содержащая наследственную информацию вируса. Именно ее определяет анализ методом ПЦР (полимеразной цепной реакции). Это ключевой этап диагностики, подтверждающий инфицирование гепатитом. Также по строению РНК определяют генотип HCV. Эти данные нужны для выбора терапии, поскольку некоторые подтипы (3а, 3б) не поддаются традиционному лечению интерфероном. Для достоверного результата потребуется соблюдать правила подготовки к исследованию.
Что такое РНК вируса
РНК, или рибонуклеиновая кислота, – это уникальный генетический материал организма. У вирусных гепатитов С от конструкции РНК зависит устойчивость вируса к разным типам лечения и особенности протекания болезни. Появление в крови фрагментов вирусной РНК значит, что болезнь вступила в острую фазу.
У хронических больных в состоянии ремиссии кровь также содержит РНК гепатита С и антитела к ней, но в меньшем объеме, чем при обострениях. Тем не менее, этого количества вируса все равно достаточно для заражения здоровых людей.
Кому назначают диагностику
Обследование крови на РНК HCV нужно в таких случаях:
- При обнаружении антител или повышения печеночных ферментов у человека, считающегося здоровым. Анализы на разные виды гепатита проводят для выявления болезни или ее исключения из списка возможных причин разрушения клеток печени.
- Когда лечат уже обнаруженный гепатит для отслеживания эффективности терапии. Контроль за уровнем вирусной РНК в крови своевременно выявит резистентность (устойчивость) к принимаемым лекарствам.
- После выздоровления на протяжении года – чтобы вовремя заметить рецидив.
Техника проведения анализа
Методом ПЦР обнаруживают нуклеиновые элементы, входящие в состав белковой оболочки вируса. Полимеразная цепная реакция выявляет:
- присутствие фрагментов HCV в крови;
- уровень вирусной нагрузки – количество частиц в миллилитре крови;
- генотип гепатита.
Важно правильно подготовиться к забору крови из вены для полимеразной реакции, чтобы не было искажений в результате теста. Для этого:
- Не употреблять алкоголь, энергетики, жирную и жареную пищу в течение 3 дней до сдачи теста.
- Избегать физических и нервных нагрузок за 2-3 дня до анализа.
- Отказаться от приема лекарств, а если это невозможно – уведомить врача о принимаемых препаратах.
- Не сдавать анализ во время обострения хронических вирусных болезней, а также при ОРВИ.
- При беременности и во время менструации предупредить врача о своем состоянии, поскольку гормональные нарушения в этот период вызывают искажения результатов.
Расшифровка
Обработка крови состоит из трех этапов:
- Определение РНК вируса гепатита в крови (качественный анализ).
- Оценка вирусной нагрузки (количественный анализ). Применяется только при положительном результате первого (когда в материале обнаружено присутствие вируса).
- Генотипирование. Его проводят при первом обращении по подозрению на гепатит, а также при низкой эффективности терапии – чтобы выявить мутацию вируса.
При подозрении на ложный результат потребуется повторно пройти обследование через 2 недели.
Качественный анализ
На оборудовании большинства лабораторий гепатит С будет выявлен, если количество частиц больше 50 МЕ/мл (международных единиц на миллилитр крови). Редкие диагностические аппараты способны выявить гепатит при уровне 10 МЕ/мл. При меньшем количестве частиц вируса будет получен ложноотрицательный результат (гепатита C не обнаружено).
Присутствие в крови антител с одновременным отрицательным результатом на тестирование по вирусу – причина пройти повторное обследование через 2 недели. Также можно обратиться в другую лабораторию с более современным оборудованием для диагностики.
Количественный анализ
По результатам количественного теста можно определить, насколько эффективно организм борется с гепатитом С. Этим тестом определяют прогресс болезни, а также действенность терапевтической программы. Уровень вируса в крови определяют в МЕ/мл. В зависимости от результатов пациента относят к одной из пяти групп:
- Здоров (вируса не обнаружено).
- Минимальный уровень вируса в крови (меньше 180 МЕ/мл. Условно здоров. Иногда может означать ложноположительный результат или скрытое носительство без болезни.
- Болен с низкой вирусной нагрузкой (менее 800 тыс. МЕ/мл)
- Болен с высокой вирусной нагрузкой (от 800 тыс. до 2.5 млн. МЕ/мл)
- Терминальная вирусная нагрузка (более 2,5 млн. МЕ/мл).
От регресса вирусной нагрузки зависит длительность терапии. При слишком медленном падении активности вируса (плохой эффективности терапии) лечение растягивается на полгода и более. Если вирус удастся уничтожить быстрей, срок лечения не превышает 3 месяцев.
Генотипирование
Существует 11 генотипов вируса с различными подтипами. Некоторые из них вводят больных в группу риска по онкологии и фиброзу сильней остальных, другие не поддаются стандартной терапии интерфероном. В идеале генотипирование нужно провести при первичном обнаружении гепатита. Но из-за ограниченности ресурсов к этому анализу прибегают только при отсутствии результатов терапии.
Если есть возможность сделать генотипирование платно, обязательно нужно ею воспользоваться. Этот анализ предотвратит потерю времени на терапию, которая может быть неэффективна при редком субтипе гепатита С.
Как часто нужно сдавать кровь на диагностику
Регулярное обследование на гепатит показано:
- Людям, которые входят в группу риска из-за профессии или вредных привычек. К первым относятся врачи, ко вторым – наркоманы и люди, практикующие беспорядочные половые связи без использования презервативов.
- Проходящим терапию – для отслеживания эффективности лечения.
- Излечившимся от гепатита с целью предотвращения рецидивов.
Кровь на профилактическое обследование у группы риска берут раз 3-6 месяцев. Во время лечения потребуется сдавать анализы чаще – раз в 4-6 недель. При сомнениях в эффективности оборудования той лаборатории, где проводятся анализы, лучше сдать тест в нескольких клиниках одновременно.
Источник
[09-010]
HCV, генотипирование (типы 1a, 1b, 2, 3a, 4), РНК [реал-тайм ПЦР]
1355 руб.
Молекулярно-генетическое исследование для определения генотипа вируса гепатита С.
Применяемый набор реагентов может быть использован для диагностики вируса гепатита С и наиболее распространенных на территории России генотипов HCV (1a, 1b, 2, 3a и 4) in vitro.
Синонимы русские
Вирус гепатита С (ВГС).
Синонимы английские
Hepatitis C Virus (HCV) Genotyping, HCV Subtype.
Метод исследования
Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией в режиме реального времени.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Венозную кровь.
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Не курить в течение 30 минут до исследования.
Общая информация об исследовании
Вирус гепатита С (ВГС) способен поражать клетки печени, а также некоторые клетки крови (нейтрофилы, моноциты, В-лимфоциты). В основном инфекция передается через кровь (препараты для переливания элементов крови и плазмы, донорские органы, нестерильные шприцы, иглы, инструменты), реже вероятно заражение половым путем.
Острый вирусный гепатит, как правило, протекает бессимптомно и в большинстве случаев остается невыявленным. У 60-85 % инфицированных развивается хроническая инфекция, которая увеличивает риск развития цирроза, печеночной недостаточности и гепатоцеллюлярной карциномы. За свое скрытое, но разрушительное действие инфекция получила неофициальное название «ласковый убийца».
ВГС обладает наибольшей вариабельностью среди всех возбудителей вирусных гепатитов и благодаря высокой мутационной активности способен избегать воздействия защитных механизмов иммунной системы. Геномы вируса значительно отличаются в разных странах мира и имеют различную чувствительность к препаратам интерферонов.
Существует 6 основных генотипов вируса гепатита С и около 500 субтипов. Наиболее распространен в мире генотип 1 (40-80 %). 1а тип часто выявляется в США, 1b характерен для Западной Европы и Южной Азии. Генотип 2 встречается с частотой 10-40 %. Генотип 3 распространен в Шотландии, Австралии, Индии и Пакистане. ВГС 4 типа характерен для Средней Азии и Северной Африки, генотип 5 – для Южной Африки, 6 – для некоторых стран Азии. В России преобладает генотип 1b, далее с убывающей частотой — 3, 1a, 2, в США – 1a/1b, 2b, и 3a.
Противовирусная терапия, направленная на подавление прогрессирования заболевания, в редких случаях может ускорить развитие осложнений со стороны печени. Это происходит при неправильной оценке клинических и лабораторных показателей. Генотипирование РНК вируса гепатита С позволяет спрогнозировать эффект от планируемой терапии.
Генотип 1 хуже поддается лечению, чем генотипы 2 и 3. Кроме того, биопсию печени важнее провести именно при генотипе 1. Повышенные дозы препаратов интерферона рекомендованы для пациентов с 1-м и 4-м генотипами. Курс терапии у таких пациентов должен быть продлен до 48 недель даже при отсутствии вируса в крови более 24 недель. В случае успешности лечения, которая подтверждается снижением вирусной нагрузки крови (
Генотипы 2 и 3 хорошо поддаются терапии в 80 % случаев, обычно это занимает 24 недели.
Лечение разрабатывается с учетом пола и возраста пациента, присутствующих у него симптомов, ранее проводимой терапии, структуры и функции печени, а также лабораторных показателей.
Для чего используется исследование?
- Чтобы определить необходимость лечения и спрогнозировать течение заболевания.
- Для планирования длительности противовирусной терапии и дозировки лекарств.
- Для прогнозирования эффективности лечения.
- Для принятия решения о биопсии печени.
Когда назначается исследование?
- При обнаружении РНК вируса гепатита С и планировании противовирусной терапии.
Что означают результаты?
Референсные значения: РНК HCV не обнаружена.
При обнаружении указывается генотип:
Результат | Значение |
Генотипы 1а, 1b | Очень высокий риск хронизации инфекции и развития тяжелых осложнений. Необходимо лечение более высокими дозами интерферона в течение 48 недель. |
Генотипы 2, 3a | В большинстве случаев в течение 24 недель достигается планируемый терапевтический эффект. |
Генотип 4 | Труднее поддается лечению, требует доз препаратов, отличных от применяемых при терапии с генотипами 2 или 3. |
Что может влиять на результат?
- Генотип вируса гепатита С иногда не выявляется при концентрации вируса в крови менее 1,25*10^3 МЕ/мл.
Важные замечания
- Решение о длительности терапии, необходимой дозе препаратов и прекращении лечения может принять только лечащий врач на основании биохимических анализов функции печени, биопсии (при необходимости) и вирусной нагрузки.
- Существует вероятность повторного заражения вирусным гепатитом С другого генотипа из-за отсутствия перекрестного иммунного ответа и стойкого иммунитета.
Также рекомендуется
- Anti-HCV, антитела, ИФА
- Аnti-HCV, антитела
- Антитела к структурным и неструктурным белкам вируса гепатита С
- HCV, РНК [реал-тайм ПЦР]
- HCV, РНК количественно [реал-тайм ПЦР]
- Гамма-глютамилтранспептидаза (гамма-ГТ)
- Аланинаминотрансфераза (АЛТ)
- Аспартатаминотрансфераза (АСТ)
- Фосфатаза щелочная общая
- Альбумин в сыворотке
- Билирубин общий
- Холестерол общий
- Тромбиновое время
- Фибриноген
- Общий анализ крови (без лейкоцитарной формулы и СОЭ)
- Лейкоцитарная формула
- Скорость оседания эритроцитов (СОЭ)
Кто назначает исследование?
Инфекционист, гепатолог.
Литература
- Возианова Ж. И. Инфекционные и паразитарные болезни: В 3х т. — К.: Здоровье, 2000 – Т.1.: 600-690.
- Кишкун А. А. Иммунологические и серологические исследования в клинической практике. — М.:ООО МИА, 2006 – 471-476 с.
- Germer J., Mandrekar J., and others. Hepatitis C Virus Genotypes in Clinical Specimens Tested at a National Reference Testing Laboratory in the United States. J Clin Microbiol. 2011 August; 49(8): 3040–3043. PMCID: PMC3147781.
- Kuzin S., Samokhvalov E., Zabotina E, and others. Hepatitis virus genotype structure in patients with chronic hepatitis C. Zh Mikrobiol Epidemiol Immunobiol. 2011 May-Jun;(3):33-8. PMID:21809642.
- Mahaney K, Tedeschi V, Maertens G, et al, “Genotypic Analysis of Hepatitis C Virus in American Patients,”Hepatology, 1994, 20(6):1405-11. PubMed 7982639.
- Paintsil E, Verevochkin SV, and others Hepatitis C virus infection among drug injectors in St Petersburg, Russia: social and molecular epidemiology of an endemic infection.Addiction. 2009 Nov;104(11):1881-90. Epub 2009 Aug 27. PMID:19712125.
Источник
Генотипирование РНК гепатита С – это определение принадлежности возбудителя к одному из множества штаммов. Процедура играет важную роль в выборе тактики лечения. Вирус гепатита С был идентифицирован еще 30 лет назад. Микроорганизм построен на основе молекулы РНК, принадлежит к семейству флавивирусов и по структуре похож на возбудителей желтой лихорадки, клещевого энцефалита и на других опасных микроорганизмов. Сегодня ученые исследовали его строение более подробно и выявили 6 генотипов, каждый из которых содержит 10 субтипов.
Почему надо выяснять генотип гепатита С
Разные генотипы вируса по-разному реагируют на одно и то же лекарство. Выявление генотипа вируса гепатита С (ВГС) необходимо для того, чтобы определить следующие моменты:
- выбор препаратов;
- продолжительность курса лечения;
- насколько эффективной будет терапия;
- расчет дозы противовирусных средств;
- вероятность развития внепеченочных проявлений заболевания.
Сегодня медицине известно 6 генотипов вируса и множество субтипов. Каждый из них обладает характерным поведением.
Генотип | Свойства |
Генотип 1 | Трудно поддается лечению, легко мутирует, считается наиболее опасным, часто вызывает осложнения. |
Генотип 2 | Встречается реже первого генотипа. Для заболевания характерна низкая вирусная нагрузка. Воспалительный процесс развивается медленно. Осложнения происходят редко, а выздоровление прогнозируется в 90% случаев. |
Генотип 3 | Один из самых изученных типов. Хорошо поддается лечению. Прогноз в 80% случаев благоприятный. Без терапии может давать опасные осложнения, такие, как фиброз и стеатоз печени. |
Генотипы 4, 5, 6 | Малоизученные типы. Специфическая схема лечения отсутствует, поэтому при обнаружении таких генотипов используется терапия традиционными противовирусными (Интерферон и Рибавирин) в сочетании с Софосбувиром, Даклатасвиром. |
По информации ВОЗ, вирусом гепатита С заражено около 300 млн. человек. Предполагается, что в ближайшие пару десятков лет хронический гепатит С станет основной медицинской проблемой во многих странах мира.
Методы определения штамма вируса
Для определения штамма используется молекулярно-генетическое исследование – методом ПЦР-анализа с генотипированием (HCV RNA genotyping). HCV постоянно мутирует, что помогает ему ускользать от защитных механизмов иммунной системы. Но некоторые участки его генома остаются неизменными – именно на них и ориентирован тест ПЦР.
Анализ на генотип позволяет выявить эти участки и по ним установить принадлежность вируса к тому или иному генотипу. Чувствительность анализа составляет 200 копий РНК на 1 мл плазмы крови. Исследование с генотипированием назначается, если по результатам других анализов было обнаружено присутствие ВГС в крови. Определение РНК вируса гепатита С и генотипирование является надежным методом диагностики.
Результат исследования позволяет сделать прогноз относительно течения заболевания и выбрать эффективную противовирусную терапию. В некоторых случаях дополнительно назначается биопсия печени или эластометрия (ультразвуковая диагностика эластичности паренхимы печени).
Кроме генотипирования, пациентам с ВГС обязательно проводят количественный ПЦР с целью оценить вирусную нагрузку.
Распространенные в России генотипы
Для генотипов вируса гепатита С характерно географическое различие. Так тип 1 часто называют «японским», так как здесь он получил широкое распространение. В США распространен тип 1а, его называют «американским», а в странах Европы чаще фигурирует 1b. Генотип 3 чаще регистрируется в Шотландии, Австралии, Индии и Пакистане. Тип 4 – в Средней Азии и на севере Африки. Пятый генотип характерен для Южной Африки, шестой – для стран Азии.
В Российской Федерации распространены по убывающей следующие типы: 1 (b чаще, чем а), 3 (чаще 3а), 2. Каждый из подтипов имеет свои характерные особенности.
1а
Это наиболее распространенный в России генотип гепатита С, который отличается мягким течением. Поддается лечению современными противовирусными препаратами в 98% случаев. Эта разновидность имеет 30% вероятности развития цирроза и 15% вероятности образования карциномы. В 30% случаев гепатит с генотипом 1а протекает остро, с подъемом температуры и другими признаками воспаления. По этой причине возможна ранняя диагностика заболевания, на фоне которой гепатит хорошо поддается лечению.
1б
Второй по распространенности в России генотип гепатита С. Его чаще диагностируют на Дальнем Востоке. В группе риска по заражению находятся туристы, которые посещают Таиланд. 80% носителей генотипа 1Б заразились путем переливания крови и ее компонентов. Этот вид хуже поддается лечению, требует длительной терапии, создает высокий риск рецидива. Заболевание протекает на фоне астеновегетативного синдрома, то есть сопровождается сонливостью, слабостью, хронической усталостью. Гепатит С этого подтипа часто приводит к раку печени.
Для болезни характерно длительное бессимптомное течение. Скрытый период длится 10 лет и даже больше. К концу этого времени появляются симптомы усталости, которые пациент часто принимает за переутомление на работе и возрастные изменения. Ситуацию усугубляет тот факт, что вирус обычно обнаруживается у пациентов после 40 лет.
Риск перехода в хроническую форму составляет 70%. Хронический гепатит С 1б тяжело лечится, протекает с необратимыми последствиями для организма. На прогноз влияет возраст, сопутствующие заболевания, переносимость лекарственной терапии. Если лечение было назначено своевременно и адекватно, прогноз благоприятный.
2
Генотип 2 переносится легче других видов инфекции, не вызывает осложнений, несовместимых с жизнью, успешно поддается терапии. Это наименее распространенный тип, для которого характерна минимальная или нулевая симптоматика на начальном этапе заболевания, а также медленно протекающий воспалительный процесс. В активной фазе возникают такие симптомы:
- тошнота, рвота;
- отсутствие аппетита;
- головная боль, головокружение;
- слабость;
- температура до 37,5°С;
- боли в суставах;
- боль и увеличение печени;
- желтуха и кожный зуд.
Статистика излечения составляет 70-100%.
3
Подтип 3а встречается чаще, чем 3в. Вирус гепатита С подтипа 3 поражает в основном людей с алкогольной и наркотической зависимостью, но прогноз на выживаемость у него самый благоприятный. Имеет длительный бессимптомный период, а в период манифестации проявляется в виде головокружений, головных болей, слабости, утомляемости. Часто отмечаются «блуждающие» суставные боли, снижение аппетита, изменение цвета мочи и кала, боль в области печени, температура до 37,5°С, желтуха, кожный зуд.
Прогноз зависит от разных обстоятельств – у женщин лечение проходит в среднем успешнее, чем у мужчин. Вероятность выздоровления понижается с возрастом, при наличии лишнего веса, при высокой вирусной нагрузке и существенном повреждении печени.
Подбор лечения после генотипирования
До 2011 года для лечения гепатита С использовалась монотерапия интерфероном или комбинация интерферона и рибавирина. Лечение имело низкую результативность. Длительное применение интерферона вызывало устойчивую депрессию и другие нарушения в работе нервной системы, общее ухудшение самочувствия, головные боли, облысение.
С появлением препарата нового поколения схема лечения изменилась. Таким лекарством стал Софосбувир (торговое название Совальди). Препарат препятствует размножению вируса гепатита С, на фоне почти полного отсутствия побочных эффектов. Устойчивый результат достигается при лечении курсом в 12 недель.
Обычно Софосбувир назначается в составе комбинированной терапии вместе с Даклатасвиром (Даклинза), Ледипасвиром (торговое название Харвони) и Велпатасвиром (торговое название Эпклуса). Состав терапии назначается в зависимости от генотипа.
Тип гепатита С | Схема лечения | Длительность курса терапии |
1 генотип | Софосбувир и Даклатасвир | 3-6 месяцев |
Софосбувир и Ледипасвир | 3-6 месяцев | |
Софосбувир и Велпатасвир | 3-6 месяцев | |
Софосбувир, Даклатасвир и Рибавирин | 3-6 месяцев | |
2 генотип | Софосбувир и Даклатасвир | 3-6 месяцев |
3 генотип | Софосбувир, Даклатасвир и Рибавирин | 6 месяцев |
Препараты назначаются только после генотипирования. Схему лечения назначает врач-инфекционист или гепатолог. Нельзя самостоятельно совмещать прием разных средств во избежание нейтрализации их действия или получения нежелательных реакций.
Источник