Анализ крови на полиморфизм интерлейкина 28в
Метод определения
Метод сиквенс-специфических праймеров, ПЦР.
Исследуемый материал
Цельная кровь (с ЭДТА)
ГЕПАТИТ С – инфекционное заболевание, которое у хронически инфицированных пациентов связано с риском развития цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы. Вирус гепатита С (HCV) имеет несколько генотипов, из них наиболее часто в нашей стране встречается вирус гепатита С генотипа 1.
Современная противовирусная терапия хронического гепатита С представляет собой комбинированную терапию пегилированным интерфероном (интерферон с добавленной молекулой полиэтиленгликоля и удлиненным эффектом) и рибавирином (PEG-IFN/RBV, ПЕГ ИФН/РИБ) и позволяет добиться успеха (устойчивого вирусологического ответа) у 40-60% пациентов.
Очевидно, что выявление факторов, влияющих на успех лечения, в том числе генетических, имеет большое значение, как для врача, которому необходимы объективные критерии прогноза эффективности лечения, так и для пациента, который перед началом проведения стандартной терапии должен быть информирован о вероятности ее успеха и побочном действии используемых противовирусных препаратов.
Генетические варианты, связанные с функциями определенных цитокинов, влияют на индивидуальные особенности иммунного ответа на данную инфекцию. IL28B представляет собой интерферон-λ-3 и является лигандом цитокинового рецептора II класса. Эти лиганды запускают JAK/STAT сигнальный каскад, активируя синтез 2’,5’-олигоаденилат-синтетазы, который активирует эндо-нуклеазу. Эндонуклеаза, в свою очередь, участвует в процессах стимуляции образования фермента протеинкиназы, который блокирует синтез вирусных белков.
Показано, что полиморфизмы, ассоциированные с геном IL28B, связаны с вероятностью самопроизвольной элиминации HCV и ответа на противовирусную терапию. Основную роль играют две замены: замена цитозина на тимин (C>T) в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860 и замена тимина на гуанин (T>G) в однонуклеотидном полиморфизме rs8099917.
По однонуклеотидному полиморфизму rs12979860 генотип С/С связан с вдвое более высокой вероятностью положительного ответа на лечение интерфероном и рибавирином, в то время как генотипы T/C и T/T в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение. Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции. Иммунная система носителей аллелей С/С более способна самостоятельно побеждать вирус. Интересно, что при генотипе С/С вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей Т/Т.
По однонуклеотидному полиморфизму rs8099917 генотип Т/Т связан со спонтанным разрешением инфекции, независимо от лечения, в то время как генотипы G/T и G/G в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение и достижения устойчивого вирусологического ответа. Аллель G в rs8099917 является аллелем риска и ассоциирован с низким уровнем ответа на терапию пегилированным интерфероном и рибавирином.
Исследования роли генетического полиморфизма указанных участков человеческого генома показали, что положительное предсказательное значение полиморфизма IL28B выше, чем других базовых характеристик, применяемых для прогноза успеха терапии (индекс массы тела, возраст, стадия фиброза и вирусная нагрузка). Однако, в исследованиях на больших популяциях больных хроническим гепатитом с различным клиническим профилем (стадия фиброза печени от 0 до 4, исходный уровень виремии низкий и высокий) было показано, что предсказательное значение генотипа пациента по IL28 для достижения устойчивого вирусологического ответа может существенно модифицироваться в зависимости от клинических характеристик и снижаться с 74,4% до 37,3% для пациентов с генотипом rs12979860 С/С. Поэтому генетические маркеры необходимо учитывать в комплексе с другими базовыми характеристиками конкретного пациента. Показано, что наибольшее значение полиморфизм IL28B имеет при инфицировании 1 субтипом HCV.
На основании этого рекомендуют следующий алгоритм обследования при подготовке к лечению.
Рекомендованный алгоритм обследования перед началом терапии гепатита
Определение генотипа пациента по IL28B поможет в принятии решения о применении стандартного курса терапии хронического гепатита С ПЕГ ИФН/РИБ и при необходимости индивидуальной оптимизации терапии за счет включения ингибиторов протеазы – телапревира и боцепревира.
Литература
1. Внутренние болезни по Тинсли Р.Харрисону. Практика 2005. 3388 с.
2. Ghary M.G. et al. Diagnosis, management and treatment of hepatitis C: an update. American Association for the Study of Liver Diseases. Hepatology. 2009, Apr; 49 (4): 1335–1374
3. Thomas D.L. et al. Genetic variation in IL28 B and spontaneous clearance of hepatitis C virus. Nature. 2009. Vol. 461, № 7265. P. 798–801.
4. Thompson A.J. et al. Interleukin-28 B polymorphism improves viral kinetics and is the strongest pretreatment predictor of sustained virologic response in genotype 1 hepatitis C virus. Gastroenterology. 2010, Jul; 139 (1): 120–129
5. Материалы производителя реагентов.
Источник
Роль полиморфизмов гена интерлейкина 28В в прогнозах лечения вирусного гепатита С
Вирусный гепатит С был
объявлен европейской ассоциацией по изучению печени излечимым
заболеванием. Это означает, что ограниченный по времени курс лечения
противовирусными препаратами назначается пациенту один раз. В результате
лечения достигается элиминация вируса из крови (устойчивый
вирусологический ответ – УВО), нормализация биохимических показателей
крови, улучшение состояния печени по данным УЗИ и эластометрии
(снижение показателей фиброза вплоть до нормальных значений).
Однако, УВО достигается не всегда. Кроме того, среди пациентов,
прошедших курс стандартной противовирусной терапии, возможны рецидивы
заболевания. В этих случаях назначаются повторные курсы лечения,
которые часто приводят к достижению УВО.
Отсутствие адэкватного анализа, позволяющего подтвердить
выздоровление, а именно удаление вируса не только из крови, но и из
печеночных клеток, заставляет гепатологов искать те факторы, которые
влияют на прогноз эффективности лечения. К ним относятся факторы вируса
– его генотип, и факторы хозяина. Среди этих факторов есть те, на
которые нельзя влиять (пол, возраст, длительность заболевания,
состояние печени на момент начала лечения), а также факторы, которые
можно изменить (например, масса тела и особенности метаболизма).
Как показали исследования последних лет, особое влияние на результат
лечения, а также возможность самостоятельного выздоровления при
заражении вирусом гепатита С, оказывают генетические факторы, особенно
полиморфизмы гена интерлейкина 28В.
Интерлейкин 28В является представителем интерферонов-лямбда, или
интерферонов 3 типа, обладающих сильным противовирусным действием и
подавляющих репликацию вируса гепатита С. Были изучены полиморфизмы
гена интерлейкина 28В, связанные с устойчивым вирусологическим ответом.
При определенных генотипах достижение устойчивого вирусологического
ответа достигается в 2 раза чаще.
Для оценки прогноза гепатита С чаще всего используются два
основных полиморфизма: rs12979860 и rs8099917. В зависимости от
нуклеотидов в этих локусах, выделены аллели C (цитозин), T (тимин), G
(гуанин) и соответствующие генотипы: для аллели rs12979860 — СС, СТ,
ТТ, а также ТТ, ТG, GG для аллелей rs8099917. Получены
данные, что генотип интерлейкина 28В является независимым и наиболее
достоверным фактором, влияющим на частоту раннего и устойчивого
вирусологического ответа на ПВТ среди других факторов прогноза. При
этом полиморфизмы rs12979860 отвечают за получение ответа, а
полиморфизмы rs8099917 тесно связаны с отсутствием ответа на ПВТ.
Более успешные результаты ПВТ получены у больных с генотипами СС
rs1297960 и ТТ rs8099917 – более 70 %, по сравнению с генотипами
rs1297960 СТ и ТТ и генотипами rs8099917 GT и GG – около 30 %. Определение
полиморфизмов интерлейкина 28В позволяют прогнозировать вероятность
достижения УВО с чувствительностью более 60 % и специфичностью около 80
%. Благоприятными аллелями являются rs1297960 CC и rs8099917 ТТ. Все другие генотипы определяют отрицательный прогноз.
Благоприятные генотипы часто ассоциируются с большей
воспалительной активностью и стадией фиброза. Кроме того, отмечена связь
полиморфизма rs12979860 Т с возникновением гепатоцеллюлярной
карциномы. Носительство этого аллеля расценивается как независимый
фактор риска в сочетании с другими известными факторами риска.
Определение генотипа интерлейкина 28В и учет других неблагоприятных
факторов прогноза противовирусной терапии позволяет искать пути
повышения эффективности лечения сразу при назначении терапии. Было
показано, что увеличение дозы интерферона в 2 раза у пациентов с
неблагоприятным генотипом интерлейкина 28В увеличивало эффективность
лечения и снижало количество рецидивов значительно в меньшей степени,
чем увеличение длительности лечения до 72 недель. Более того, у больных
с благоприятным генотипом и быстрым вирусологическим ответом возможно
укорочение сроков лечения до 24 недель.
Таким образом, связь генотипов интерлейкина 28В с достижением устойчивого вирусологического ответа достоверна. Изучение
полиморфизма гена интрлейкина 28В наряду с другими факторами прогноза
дает возможность более четко определить прогноз течения инфекции и
эффективности лечения. Это важный шаг к индивидуализированной
противовирусной терапии, позволяющий индивидуально определять сроки
лечения и дозы препаратов, и не только увеличивая их, но и уменьшая. (Лечение гепатита С)
Источник
Ген интерлейкина 28B, II класс цитокиновых рецепторов (IL28B). Выявление мутации g.39738787C>T (rs12979860, регуляторная область гена)
Название гена — IL28B
OMIM — *607402
Локализация гена на хромосоме — 19q13.2
Функция гена
Ген IL28B кодирует белок интерферон-лямбда-3, который является лигандом цитокинового рецептора II класса. IL28B запускает JAK/STAT-сигнальный каскад, передающий информацию от внеклеточных полипептидных сигналов к промоторам генов-мишеней, блокируя синтез вирусных белков.
Генетический маркер rs12979860
Участок ДНК в регуляторной области гена IL28B, в котором происходит замена нуклеотида цитозина (С) на тимин (Т), обозначается как генетический маркер g.39738787C>T или rs12979860.
rs12979860 – обозначение однонуклеотидного полиморфизма по базе данных NCBI.
Возможные генотипы
- С/С
- С/Т
- Т/Т
Встречаемость в популяции
Встречаемость минорного (Т) аллеля в европейской популяции составляет 32 %.
Ассоциация маркера с заболеваниями
Маркер связан с генетической резистентностью к вирусным инфекциям и эффективностью лечения хронического гепатита С препаратами рибавирин («Ребетол») и PEG-интерферон («ПегИнтрон»). Полиморфизм IL28B определяет как вероятность самопроизвольной элиминации вируса, так и ответ на противовирусную терапию. Анализ назначается:
- перед началом терапии хронического гепатита С – прогнозирование ответа на лечение;
- при выборе тактики лечения хронического гепатита С.
Общая информация об исследовании
Вирус гепатита С в основном передается через кровь. Им поражено около 3 % населения мира. Инфекция вызывает острый гепатит и характеризуется отсутствием достаточного иммунного ответа. В 50-80 % случаев он переходит в хроническую форму и приводит к циррозу печени и гепатоцеллюлярной карциноме.
В настоящее время в качестве противовирусной терапии (ПВТ) гепатита С наиболее часто применяется сочетание двух препаратов – интерферона-альфа («PEG-интерферона») и рибавирина, что подтверждается международными исследованиями и клинической практикой.
Основной задачей противовирусной терапии является профилактика цирроза печени и гепатокарциномы. Курс лечения хронического вирусного гепатита С продолжается 16-72 недели. При таком длительном применении данных препаратов развивается ряд выраженных побочных эффектов, так что в некоторых случаях лечение приходится прекратить. Эффективность противовирусной терапии зависит от многих факторов: генотипа вируса, исходной вирусной нагрузки, длительности инфицирования, обмена железа в организме, активности трансаминаз, избыточной массы тела, стеатоза печени, инсулинорезистентности, возраста, пола, алкогольной и наркотической зависимости, сопутствующих заболеваний, наличия выраженного фиброза.
Достижение устойчивого вирусологического ответа, а также определение риска побочных реакций при приеме противовирусных препаратов очень важны для больного. В последнее время, чтобы оценить эффективность начальной или повторной ПВТ, используют индивидуальный генетический фактор – статус гена IL28B. Наибольшее диагностическое значение он имеет при лечении ХГС, вызванного 1-м генотипом вируса. При ХГС, вызванном 2-м и 3-м генотипами вируса, полиморфизм гена IL28B значим только для пациентов, у которых не достигнут быстрый вирусологический ответ (отсутствие РНК вируса гепатита С на 4-й неделе лечения).
Распределение генотипов IL28B отличается в различных популяциях по всему миру и объясняет разную эффективность противовирусной терапии PEG-интерфероном и рибавирином в этнических группах.
Генетическое исследование рекомендуется выполнять перед началом противовирусной терапии для прогноза эффективности терапии и при выборе тактики лечения.
При выявлении у пациента генотипа СС наблюдается:
- двух-трехкратное увеличение вероятности формирования УВО на ПВТ;
- вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей ТТ и СТ.
Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции.
Для пациентов с генотипами С/Т и Т/Т характерно снижение вероятности ответа на ПВТ, т. е. низкая эффективность лечения.
Источник
Метод определения
Метод сиквенс-специфических праймеров, ПЦР.
Исследуемый материал
Цельная кровь (с ЭДТА)
ГЕПАТИТ С – инфекционное заболевание, которое у хронически инфицированных пациентов связано с риском развития цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы. Вирус гепатита С (HCV) имеет несколько генотипов, из них наиболее часто в нашей стране встречается вирус гепатита С генотипа 1.
Современная противовирусная терапия хронического гепатита С представляет собой комбинированную терапию пегилированным интерфероном (интерферон с добавленной молекулой полиэтиленгликоля и удлиненным эффектом) и рибавирином (PEG-IFN/RBV, ПЕГ ИФН/РИБ) и позволяет добиться успеха (устойчивого вирусологического ответа) у 40-60% пациентов.
Очевидно, что выявление факторов, влияющих на успех лечения, в том числе генетических, имеет большое значение, как для врача, которому необходимы объективные критерии прогноза эффективности лечения, так и для пациента, который перед началом проведения стандартной терапии должен быть информирован о вероятности ее успеха и побочном действии используемых противовирусных препаратов.
Генетические варианты, связанные с функциями определенных цитокинов, влияют на индивидуальные особенности иммунного ответа на данную инфекцию. IL28B представляет собой интерферон-λ-3 и является лигандом цитокинового рецептора II класса. Эти лиганды запускают JAK/STAT сигнальный каскад, активируя синтез 2’,5’-олигоаденилат-синтетазы, который активирует эндо-нуклеазу. Эндонуклеаза, в свою очередь, участвует в процессах стимуляции образования фермента протеинкиназы, который блокирует синтез вирусных белков.
Показано, что полиморфизмы, ассоциированные с геном IL28B, связаны с вероятностью самопроизвольной элиминации HCV и ответа на противовирусную терапию. Основную роль играют две замены: замена цитозина на тимин (C>T) в однонуклеотидном полиморфизме rs12979860 и замена тимина на гуанин (T>G) в однонуклеотидном полиморфизме rs8099917.
По однонуклеотидному полиморфизму rs12979860 генотип С/С связан с вдвое более высокой вероятностью положительного ответа на лечение интерфероном и рибавирином, в то время как генотипы T/C и T/T в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение. Генотип СС преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции. Иммунная система носителей аллелей С/С более способна самостоятельно побеждать вирус. Интересно, что при генотипе С/С вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей Т/Т.
По однонуклеотидному полиморфизму rs8099917 генотип Т/Т связан со спонтанным разрешением инфекции, независимо от лечения, в то время как генотипы G/T и G/G в этой позиции связаны с меньшей вероятностью ответа на лечение и достижения устойчивого вирусологического ответа. Аллель G в rs8099917 является аллелем риска и ассоциирован с низким уровнем ответа на терапию пегилированным интерфероном и рибавирином.
Исследования роли генетического полиморфизма указанных участков человеческого генома показали, что положительное предсказательное значение полиморфизма IL28B выше, чем других базовых характеристик, применяемых для прогноза успеха терапии (индекс массы тела, возраст, стадия фиброза и вирусная нагрузка). Однако, в исследованиях на больших популяциях больных хроническим гепатитом с различным клиническим профилем (стадия фиброза печени от 0 до 4, исходный уровень виремии низкий и высокий) было показано, что предсказательное значение генотипа пациента по IL28 для достижения устойчивого вирусологического ответа может существенно модифицироваться в зависимости от клинических характеристик и снижаться с 74,4% до 37,3% для пациентов с генотипом rs12979860 С/С. Поэтому генетические маркеры необходимо учитывать в комплексе с другими базовыми характеристиками конкретного пациента. Показано, что наибольшее значение полиморфизм IL28B имеет при инфицировании 1 субтипом HCV.
На основании этого рекомендуют следующий алгоритм обследования при подготовке к лечению.
Рекомендованный алгоритм обследования перед началом терапии гепатита
Определение генотипа пациента по IL28B поможет в принятии решения о применении стандартного курса терапии хронического гепатита С ПЕГ ИФН/РИБ и при необходимости индивидуальной оптимизации терапии за счет включения ингибиторов протеазы – телапревира и боцепревира.
Литература
1. Внутренние болезни по Тинсли Р.Харрисону. Практика 2005. 3388 с.
2. Ghary M.G. et al. Diagnosis, management and treatment of hepatitis C: an update. American Association for the Study of Liver Diseases. Hepatology. 2009, Apr; 49 (4): 1335–1374
3. Thomas D.L. et al. Genetic variation in IL28 B and spontaneous clearance of hepatitis C virus. Nature. 2009. Vol. 461, № 7265. P. 798–801.
4. Thompson A.J. et al. Interleukin-28 B polymorphism improves viral kinetics and is the strongest pretreatment predictor of sustained virologic response in genotype 1 hepatitis C virus. Gastroenterology. 2010, Jul; 139 (1): 120–129
5. Материалы производителя реагентов.
Источник