Анализ крови на пцр к гриппу

Анализ крови на пцр к гриппу thumbnail

Метод определения
Полимеразная цепная реакция с детекцией в режиме реального времени (Real-time PCR).

Исследуемый материал
Соскоб эпителиальных клеток рото- и носоглотки

Определение РНК вируса гриппа в соскобе эпителиальных клеток ротоглотки и носоглотки методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с детекцией в режиме реального времени.

Грипп – острая респираторная вирусная инфекция, передаваемая воздушно-капельным путем. 

Возбудители гриппа – РНК-содержащие вирусы, относящиеся к семейству Orthomyxoviridae, в котором выделяют три рода: Influenza A virus, Influenza B virus, Influenza C virus. 

Вирусы гриппа А и В ежегодно вызывают эпидемии большей или меньшей интенсивности практически во всех странах мира. Вирусы гриппа А широко распространены в природе, их выделяют у большинства зверей и птиц, в связи с чем они имеют высокий пандемический потенциал, так как способны преодолевать межвидовый барьер. Основной причиной возникновения эпидемий и пандемий гриппа является высокая вариабельность вируса вследствие изменений в его геноме. Это касается фрагментов, кодирующих поверхностные антигены вирусов типов А и В и определяющих их специфичность. 

Вирусы Influenza А и B поражают преимущественно верхние отделы дыхательных путей: нос, горло, трахею и реже бронхи. Однако симптомы общей интоксикации при гриппе доминируют над умеренными катаральными проявлениями. Обычно заболевание сопровождается резким повышением температуры, мышечными и головной болями, сильным недомоганием, сухим кашлем, болью в горле и слизистыми выделениями из носа. Для гриппа, обусловленного новым или значительно измененным вирусом (например, для гриппа птиц типа А(H5N1) и А(H7N9), реже А (H1N1) pdm 2009), характерно острейшее, молниеносное начало, развитие различных вариантов токсикоза (нейротоксикоза, инфекционно-токсического шока в сочетании с гемодинамическими расстройствами) и III степени ДВС-синдрома (гемокоагуляционного шока). 

Диагностика инфекции осуществляется комплексно, на основании анамнестических данных о контакте с больными гриппом и характерной клинической картины. Подтверждение диагноза возможно с помощью лабораторных исследований, что целесообразно при наличии клинических проявлений гриппа, в эпидемический сезон роста заболеваемости острыми респираторными инфекциями, при тяжелом течении респираторных болезней. 

В качестве базовых тестов могут быть использованы следующие лабораторные исследования: определение антигенов вируса гриппа в мазках слизистой носа и ротоглотки методом непрямой иммунофлуоресценции или иммунохроматографии; определение антител к антигенам вируса гриппа А/B в сыворотке крови методом ИФА. Результаты ИФА, как правило, оцениваются ретроспективно. Вследствие поздней диагностики они не влияют на коррекцию терапии, но применимы в научных целях и для эпидемиологического надзора и контроля за гриппом. Наиболее современным методом лабораторной диагностики гриппа является выявление РНК вируса методом ПЦР. 

Максимального уровня специфичности и чувствительности достигают тесты на основе ПЦР-ОТ (полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации в режиме реального времени, позволяющие обнаруживать в биологическом материале РНК возбудителя инфекции.

Аналитические показатели: 

определяемый фрагмент – специфический участок нуклеиновой кислоты вирусов гриппа А (Influenza virus A) и гриппа В (Influenza virus B); 

специфичность обнаружения – отсутствие неспецифических реакций в отношении других вирусных и бактериальных возбудителей ОРЗ. 

Аналитическая чувствительность: 

вирус гриппа А (Influenza virus A) – 1х10^3 ГЭ/мл пробы; 

вирус гриппа В (Influenza virus В) – 1х10^3 ГЭ/мл пробы. 

Литература

  1. Грипп у взрослых. Клинические рекомендации. МЗ РФ. 2017:57. https://cr.rosminzdrav.ru/#!/schema/909  
  2. Грипп у детей. Клинические рекомендации. МЗ РФ. 2017:43. https://cr.rosminzdrav.ru/#!/schema/172  
  3. Грипп у взрослых: методические рекомендации по диагностике, лечению, специфической и неспецифической профилактике. Под ред. академика, профессора А.Г. Чучалина, главного внештатного инфекциониста СЗФО проф. Т.В. Сологуб. — СПб.: Издательско-полиграфический комплекс «НП-Принт». 2014:192.  
  4. Яцышина С.Б., Творогова М.Г., Шипулин Г.А., Малеев В.В. Лабораторная диагностика гриппа и других ОРВИ методом полимеразной цепной реакции. Лабораторная служба. 2017;6(3):238-267. https://doi: 10.17116/labs201763238-267.

Источник

Грипп, начавшийся в этом сезоне, опасен серьезными осложнениями, поэтому очень важно как можно раньше поставить точный диагноз, чтобы назначить адекватное лечение. И тем более важно отличить грипп от других респираторных инфекций.

В этом сезоне основным эпидемическим штаммом является пандемический вирус гриппа А/H1N1pdm09 «свиного» происхождения.

Также возможно заражение вирусом гриппа B и А/H3N2, а также инфицирование одним из 13 возбудителей ОРВИ, вызывающих гриппоподобные симптомы.

Каждый из вирусов имеет свои особенности, и заболевание требует индивидуального подхода к лечению. Грипп, вызванный вирусом A/H3N2 тяжело переносят дети до 5 лет, пожилые люди, лица с хроническими заболеваниями бронхо-легочной и сердечно-сосудистой системы. «Свиной грипп» тяжело переносят люди среднего возраста, чаще с хроническими заболеваниями сердечно-сосудистой системы, ожирением, сахарным диабетом, бронхиальной астмой и беременные женщины. При эпидемии гриппа 2009 года, вызванной «свиным» штаммом А/H1N1pdm09 летальный исход чаще наблюдался у лиц в возрасте от 30 до 67 лет, причем в 21% случаев в начале заболевания температура не поднималась выше 38оС и около 10% не имели каких-либо хронических заболеваний.

Читайте также:  Вита клиника вологда цены на анализы крови

Инфицирование детей до 2х лет респираторно-синцитиальным вирусом, вирусами парагриппа и бокавирусом может привести к тяжелым состояниям, требующим госпитализации — крупу и бронхо-обструктивному синдрому. Респираторно-синцитиальный вирус, метапневмовирус, вирусы гриппа и аденовирусы могут вызвать бронхиты и пневмонию преимущественно у детей до 5 лет.

Каким возбудителем инфицирован человек, может сказать только лабораторная диагностика, по клинической картине, к сожалению, это сделать невозможно.

Лабораторный анализ на определение гриппа и других возбудителей респираторной инфекции даёт возможность назначить адекватное лечение, точно определить прогноз, не допустить характерных для каждого возбудителя осложнений и в ряде случаев избежать необоснованной антибиотикотерапии.

Где можно сдать анализ на грипп?

Сдать анализ на вирус гриппа и другие возбудители респираторных инфекций можно в Центре Молекулярной диагностики (CMD) ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. Диагностические тесты позволяют выявить возбудителей гриппа, ОРВИ, микоплазменной и хламидийной инфекций, коклюша и других острых респираторных заболеваний в течение одного дня. Целесообразно сдавать анализ на выявление гриппа и возбудителей ОРВИ при подозрении на вирусную инфекцию в первые — вторые сутки заболевания, когда возбудитель содержится в максимальном количестве. Помните, что точный диагноз — правильное лечение!

Диагностика гриппа и острых респираторных вирусных инфекций в CMD:

  • Вирус гриппа (Myxovirus influenzae) А и В, качественное определение РНК, ПЦР
  • Вирус гриппа (Myxovirus influenzae) А и В/ Вирус парагриппа (Parainfluenzae virus) 1,2,3,4 типов, качественное определение РНК
  • Вирус гриппа (Myxovirus influenzae) А, А/Н1N1/СА/2009, В, качественное определение РНК, ПЦР
  • Диагностика ОРВИ. Возбудители респираторных вирусных инфекций (РНК Respiratory Syncytial virus, РНК Metapneumovirus, РНК Coronavirus, РНК Rhinovirus, ДНК Adenovirus B, C, E, ДНК Bocavirus, РНК Parainfluenza virus 1, 2, 3, 4),качественное определение,ПЦР
  • Возбудители респираторных инфекций

Как работают диагностические тесты

Молекулярно-генетические методы, в частности полимеразная цепная реакция (ПЦР), способны обнаружить геном возбудителя в мазке из носоглотки заболевшего.

ПЦР — быстрый прямой метод диагностики, обнаруживающий специфичные участки генома микробов, то есть отличающие их друг от друга. Именно поэтому метод ПЦР по сути является экспресс-анализом на грипп и другие респираторные инфекции.

ПЦР увеличивает в миллиард раз количество этих участков за счет работы фермента ДНК-полимеразы, достраивающего цепи ДНК после присоединения к специфическим участкам коротких молекул олигонуклеотидов — праймеров. В процессе достраивания цепей ДНК происходит разрушение ДНК-полимеразой меченой флуоресцентными красителями молекулы – олигонуклеотидного зонда, также специфично отжигающегося на участке ДНК искомого возбудителя, и преграждающего путь движущегося фермента.

Чем больше возбудителя было в образце клинического материала пациента, тем раньше приборы будут фиксировать увеличение над пороговым значением уровня флуоресценции в процессе реакции. Анализ проводится с детекцией в режиме реального времени. Если в образце нет возбудителя, повышение уровня флуоресценции не происходит. В процессе разработки тестов они обязательно проверяются на специфичность, то есть отсутствие перекреста с другими вирусами и бактериями.

Источник

[09-120]
Influenza virus A/B (вирусы гриппа А/В), РНК [реал-тайм ПЦР]

1230 руб.

Выявление вируса гриппа серотипов А и В (Influenza virus A/B), в ходе которого с помощью метода полимеразной цепной реакции в реальном времени (РТ-ПЦР) определяется генетический материал (РНК) вируса в образце биоматериала.

Синонимы русские

Грипп А/В.

Синонимы английские

Influenza serotypes A/B, RNA [real-time polymerase chain reaction, RT-PCR, quantitative RT-PCR, qPCR, qRT-PCR].

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Мазок из зева (ротоглотки) и носа, мокроту.

Как правильно подготовиться к исследованию?

  • Рекомендуется употребить большой объем жидкости (воды) за 8-12 часов до сбора мокроты.
  • Не принимать пищу, не пить и не полоскать горло в течение 2-3 часов до исследования.
  • За 3-4 часа до взятия мазков из ротоглотки (зева) и носа не употреблять пищу, не пить, не чистить зубы, не полоскать рот/горло, не закапывать капли/спреи в нос, не жевать жевательную резинку, не курить. Взятие мазков оптимально выполнять утром, сразу после ночного сна.
Читайте также:  Анализ крови результат пределы референсных значений

Общая информация об исследовании

Influenza virus – это оболочечный вирус, характеризующийся наличием сегментированного негативного РНК-генома и нуклеокапсида в форме спирали. Он относится к семейству Orthomixoviridae. На основании структурных различий нуклеопротеида выделяют 3 серотипа Influenza: A, B и С. Серотип A встречается как людей, так и у животных, в то время как варианты B и C поражают преимущественно людей. Именно серотип А ответственен за подавляющее большинство случаев сезонных (эпидемических) и пандемических вспышек гриппа.

Идентификация вируса гриппа должна быть осуществлена в кратчайшие сроки, что связано с высокой заразностью этого заболевания. Кроме того, эффективность противовирусных препаратов максимальна при их назначении в первые 48 часов после инфицирования, что также диктует необходимость своевременной постановки окончательного диагноза. Среди многих «быстрых» диагностических тестов особое место занимает полимеразная цепная реакция в режиме реального времени (РТ-ПЦР). Полимеразная цепная реакция в реальном времени (РТ-ПЦР) – это метод молекулярной диагностики, позволяющий выявлять в биологическом материале (например, в мокроте) фрагменты генетического материала (РНК) возбудителя инфекции. Благодаря высокой чувствительности и специфичности метода, а также возможности получить результат в наболее короткие сроки, РТ-ПЦР заменила другие, применяемые ранее, методы диагностики гриппа: выделение вируса в культуре клеток, а также серологические исследования и иммуноферментный анализ.

Многие прямые лабораторные тесты, разработанные для идентификации Influenza, основаны на выявлении белковых компонентов наружной оболочки вируса: гемагглютинина (H) и нейраминидазы (N). Эти белки являются основными факторами, определяющими степень болезнетворности вируса, а также используются для диагностики и классификации выявляемого вируса гриппа. Они обладают выраженной изменчивостью (известно 16 разновидностей N и 9 разновидностей H серотипа Influenza A) (чем вызваны ежегодные сезонные вспышки гриппа), а также создает определенные трудности при идентификации вируса гриппа с помощью этих методов. Структурное разнообразие антигенов H и N приводит к тому, что чувствительность большинства прямых лабораторных тестов (таких как прямая иммунофлюоресценция и ELISA) составляет около 65-75  %. Исследование РТ-ПЦР основано на выявлении консервативной последовательности ДНК, общей для разных штаммов вируса гриппа серотипов А и В, что обуславливает максимальную чувствительность этого теста (98-100  %).

В отличие от других тестов, чувствительность исследования РТ-ПЦР практически не изменяется при взятии материала на фоне начатой терапии противовирусными препаратами. Это связано с тем, что в реакции выявляется не сам вирусный агент, а фрагмент вирусной ДНК. По этой же причине положительный результат исследования не всегда указывает на наличие живого вируса (репликацию) и не всегда означает, что пациент остается заразным для окружающих.

В отличие от других лабораторных тестов (в первую очередь, экспресс-тестов для определения антигена вируса гриппа), результат РТ-ПЦР в меньшей степени зависит от распространенности гриппа среди населения. РТ-ПЦР характеризуется редкими ложноположительными и ложноотрицательными результатами как во время эпидемии, так и в период низкой заболеваемости гриппом.

Идентификация вируса гриппа с помощью РТ-ПЦР возможна в течение более длительного времени от начала заболевания по сравнению с большинством других тестов. Тем не менее взятие отделяемого носо/ротоглотки для исследования с помощью РТ-ПЦР должно быть произведено не позднее чем через 72-96 часов (оптимально в первые 48-72 часа). Это связано с тем, что интенсивная репликация Influenza при поражении верхних дыхательных путей происходит в течение первых 4 суток заболевания. У пациентов с вовлечением нижних отделов дыхательных путей вирусная нагрузка сохраняется высокой более длительный период. Исследование отделяемого носоглотки и мокроты дает лучшие результаты по сравнению с исследованием отделяемого ротоглотки.

При обследовании пациента с клиническими признаками Influenza-ассоциированной инфекции верхних дыхательных путей следует выполнить анализ отделяемого носо/ротоглотки. При обследовании пациента с признаками Influenza-ассоциированной инфекции нижних дыхательных путей анализ мазков из зева и носа необходимо дополнить исследованием мокроты. Исследование мокроты также должно быть осуществлено при отрицательном результате, который дал анализ отделяемого верхних дыхательных путей у пациента с клиническими признаками гриппа. Следует повторить РТ-ПЦР при отрицательном результате исследования мокроты у пациента с клиническими признаками Influenza-ассоциированной инфекции нижних дыхательных путей.

Читайте также:  Анализ крови алат и асат повышены что делать

Для более точной диагностики Influenza рекомендуется сочетание РТ-ПЦР с дополнительными общеклиническими исследованиями. Кроме того, необходимо исключить бактериальную суперинфекцию.

Для чего используется исследование?

  • Для диагностики гриппа.

Когда назначается исследование?

При симптомах:

  • острой респираторной вирусной инфекции (внезапное острое начало болезни, лихорадка, боль в горле, боль в мышцах,  головная боль, светобоязнь, сухой  кашель, боль в грудной клетке, одышка);
  • острой энцефалопатии в период эпидемии гриппа (судороги, атаксия, нарушение сознания).

Что означают результаты?

Референсные значения: отрицательно.

Причины положительного результата:

  • Influenza-ассоциированная инфекция.

Причины отрицательного результата:

  • отсутствие Influenza-ассоциированной инфекции.



Важные замечания

  • Положительный результат исследования не означает, что пациент остается заразным для окружающих.
  • Анализ не позволяет выявлять Influenza серотипа С.

Также рекомендуется

  • Клинический анализ крови: общий анализ, лейкоцитарная формула, СОЭ (с микроскопией мазка крови при выявлении патологических изменений)
  • Mycoplasma pneumoniae, ДНК [реал-тайм ПЦР]
  • Adenovirus, ДНК [реал-тайм ПЦР]
  • Streptococcus pneumoniae, ДНК [реал-тайм ПЦР]

Кто назначает исследование?

Инфекционист, педиатр, врач общей практики, анестезиолог-реаниматолог.

Литература

  • Kamps B. S, Hoffmann C, Preiser W. Influenza Report 2006 / B. S. Kamps, С. Hoffmann, W. Preiser W. – Flying Publisher, 2006.
  • Wang R, Taubenberger JK. Methods for molecular surveillance of influenza. Expert Rev Anti Infect Ther. 2010 May;8(5):517-27.
  • Schuchat A, Bell BP, Redd SC. The science behind preparing and responding to pandemic influenza: the lessons and limits of science. Clin Infect Dis. 2011 Jan 1;52 Suppl 1:S8-12.
  • Pregliasco F, Mensi C, Camorali L, Anselmi G. Comparison of RT-PCR with other diagnostic assays for rapid detection of influenza viruses. J Med Virol. 1998 Oct;56(2):168-73.
  • WHO Global Influenza Surveillance Network. Manual for the laboratory diagnosis and virological surveillance of influenza. – World Health Organization, 2011.

Источник

  • Гепатит А

    Гепатит В

    Гепатит С

    Вирус гепатита C, генотип 1, 1а, 1b, 2, 3, 4, 5, 6, РНК (HCV, ПЦР ультрачувствит.) плазма, кач.

    19.129.10 дней

    Вирус гепатита C, генотип 1a, 1b, 2, 3a, 4, 5a, 6, РНК (HCV, ПЦР) плазма, кол.

    19.97.3 дня

    Гепатит D

    Гепатит G

    Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ)

    Гарднерелла вагиналис

    • Гарднерелла вагиналис (качественный анализ)

      Гарднерелла вагиналис (количественный анализ)

    Кандида альбиканс

    • Кандида альбиканс (качественный анализ)

      Кандида альбиканс (количественный анализ)

      Комплексное исследование на грибы рода Кандида

    Микоплазма хоминис

    • Микоплазма хоминис (качественный анализ)

      Микоплазма хоминис (количественный анализ)

    Уреаплазма уреалитикум

    • Уреаплазма уреалитикум (качественный анализ)

      Уреаплазма уреалитикум (количественный анализ)

      Биовары U.Urealyticum (качественный анализ)

      Биовары U.Urealyticum (количественный анализ)

    Микоплазма гениталиум

    • Микоплазма гениталиум (качественный анализ)

      Микоплазма гениталиум (количественный анализ)

    Нейссерия гонореи

    • Нейссерия гонореи (качественный анализ)

      Нейссерия гонореи (количественный анализ)

    Трихомонас вагиналис

    • Трихомонас вагиналис (качественный анализ)

      Трихомонас вагиналис (количественный анализ)

    Хламидия трахоматис

    • Хламидия трахоматис (качественный анализ)

      Хламидия трахоматис (количественный анализ)

    Трепонема паллидум

    • Трепонема паллидум (качественный анализ)

    Лактобактерии

    • Лактобактерии (качественный анализ)

      Лактобактерии (количественный анализ)

    Мобилункус

    • Мобилункус (качественный анализ)

      Мобилункус (количественный анализ)

    Бактероиды

    Папилломавирусная инфекция

    • Папилломавирусная инфекция (качественный анализ)

      Папилломавирусная инфекция (количественный анализ)

    Цитомегаловирус (вирус герпеса 5 типа)

    • Цитомегаловирус (качественный анализ)

      Цитомегаловирус (количественный анализ)

    Вирус простого герпеса 1, 2 типов

    • Вирус простого герпеса 1,2 типов (качественный анализ)

      Вирус простого герпеса 1,2 типов (количественный анализ)

    Вирус простого герпеса VI

    • Вирус простого герпеса VI типа (качественный анализ)

      Вирус простого герпеса VI типа (количественный анализ)

    Варицелла Зостер (вирус герпеса 3 типа)

    • Вирус Варицелла-Зостер (качественный анализ)

    Вирус Эпштейна-Барр (вирус герпеса 4 типа)

    • Вирус Эпштейна-Барр (вирус герпеса 4 типа) (качественный анализ)

      Вирус Эпштейна-Барр (вирус герпеса 4 типа) (количественный анализ)

    Краснуха

    • Краснуха (качественный анализ)

      Краснуха (количественный анализ)

    Клещевые инфекции

    • Клещевой энцефалит

      Боррелия бургдорфери (качественный анализ)

      Боррелия бургдорфери (количественный анализ)

    Бордетелла пертуссис

    Микоплазма пневмонии, Хламидия пневмонии

    Нейссерия менингитидис, Гемофилус инфлюенца, Стрептококкус пневмонии

    Острые кишечные инфекции

    Микобактерии туберкулеза

    • Микобактерии туберкулеза (качественный анализ)

    Хеликобактер пилори (Метод Real-Time)

    • Хеликобактер пилори (качественный анализ)

      Хеликобактер пилори (количественный анализ)

    Токсоплазма Гонди

    • Токсоплазма Гонди (качественный анализ)

      Токсоплазма Гонди (количественный анализ)

    Листерия моноцитогенес

  • Источник